Pestpodden

Artificial intelligence (AI) and the discovery of novel antibiotics - with Jonathan Stokes

Pestpodden

Show Notes

Jonathan Stokes and his colleagues are discovering novel antibiotics through artificial intelligence (AI) - among others Halicin and Abaucin. This AI-driven research was named one of the years top discoveries by The New York Times in 2023. Stay tuned for a very futuristic - and inspiring - interview with a very interesting researcher!

References: Swanson, K., Liu, G., Catacutan, D.B. et al. Generative AI for designing and validating easily synthesizable and structurally novel antibiotics. Nat Mach Intell 6, 338–353 (2024). Lluka T, Stokes JM. Antibiotic discovery in the artificial intelligence era. Ann N Y Acad Sci. 2023 Jan;1519(1):74-93. doi: Liu G, Catacutan DB, Rathod K, Swanson K, Jin W, Mohammed JC, et al. Deep learning-guided discovery of an antibiotic targeting Acinetobacter baumannii. Nature Chemical Biology. 2023;19(11):1342-50. Stokes JM, Yang K, Swanson K, Jin W, Cubillos-Ruiz A, Donghia NM, et al. A Deep Learning Approach to Antibiotic Discovery. Cell. 2020;180(4):688-702.e13. Awan RE, Zainab S, Yousuf FJ, Mughal S. AI-driven drug discovery: Exploring Abaucin as a promising treatment against multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. Health Sci Rep. 2024;7(6):e2150. Higashihira S, Simpson SJ, Morita A, Suryavanshi JR, Arnold CJ, Natoli RM, Greenfield EM. Halicin remains active against Staphylococcus aureus in biofilms grown on orthopaedically relevant substrates. Bone Joint Res. 2024 Mar 4;13(3):101-109. doi: 10.1302/2046-3758.133.BJR-2023-0038.R2. PMID: 38432258; PMCID: PMC10909403. Hosted on Acast. See acast.com/privacy for more information.

More from Pestpodden

Oct 1, 2026

Ingrid og Jørgen har vært på vift til nordisk infeksjonskonferanse i København - gled deg til en potpurri av info om endokardittbehandling, staph aureus-bakteriemi, fecal mikrobiotatransplantasjon og veldig mye annet!

Jul 24, 2026

Vi har snakket med Elin Hoffman Dahl, infeksjonsmedisiner og ph.d.-stipendiat som er på vei til utbruddet i DR Kongo. Elin har vært med på å håndtere flere Ebola-utbrudd de siste årene og deler erfaringer fra disse og siste oppdateringer rundt det aktuelle utbruddet.

Jul 24, 2026

Ebola er et høyaktuelt tema i disse dager med det pågående utbruddet i DR Kongo. For å gi litt mer bakgrunn gjør vi en historisk reise fra oppdagelsen av Ebola frem til i dag.

Jul 22, 2026

Ingrid, Jørgen og Nikolai oppsummerer etter beste evne årets ESCMID (en av verdens største infeksjonsmedisinske konferanser) og vårmøtet (kanskje en av verdens minste infeksjonskonferanser) i denne reporasje-baserte episoden av Pestpodden.

Mar 12, 2026

We take an in-depth look at cryptococcal disease with dr Neil Stone - hold tight and dive with us! This episode will go though everything from epidemiologi and risk-factors - to typical clinical pictures and treatment. Hosted on Acast. See acast.com/privacy for more information.

See all episodes →