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在AI大模型的浪潮里,AI科学家会替代我们吗?我们如何能利用好AI帮助我们?本期我们请到 斯坦福大学博士、Biomni发明者之一、CRISPR-GPT作者 屈元昊(Jerry Qu),聊聊从实验台到电脑前,AI 如何把繁琐工作流程拆解、自动化,成为每位科研人的“AI 小助手”。 本期,我们从生物科研工作者的角度,讨论AI Scientist如何影响我们的工作方式。AI Scientist到底是什么,又是如何被训练出来的?对于不开源文章,不同开发者如何训练AI Scientist?而对于质量有限或者“图片误用”的文章,AI Scientist又如何去分辨?AI Scientist会编造出答案,又如何避免它们去无中生有? Biomni是一个全能型的科研助手,而CRISPR-GPT是一个基因编辑的小专家。Jerry为何既要做“平台”又要做一个个单点工具?AI Scientist在学习和分析大数据时有独特的优势,但优势相比于人类在哪里;这些AI助手的能力边界又在哪里,他们现在到底是实习生还是博士专家?Biomni这样的全能型科研助手可以帮助我们实现科研的去中心化吗?让科研平民化,使每个人都可以成为提出问题和回答问题的科学家。
时间轴: (00:00) 时代转换:从 ChatGPT 到 AI Agent,科研工作方式的变化 (07:00) CRISPR-GPT 的起点:将“解题经验”进化成 Agent (12:20) 什么是 AI Agent:推理 + 行动的双循环 (18:00) 为何做平台:把科研工具当“乐高”拼装 (22:40) 文献可信度与一致性:如何在开源与付费资源之间做一致性判断 (27:40) 读懂图片和数据的难点 (31:40) 打通克隆/组学/结构/记录/搜索等的自动化工作流 (33:44) 走向“生物学 IDE/工作站” (40:08) 从“实习生”到“专家”的最后一公里:先验与品味 (46:06) AI会不会替代科学家?边界与机会 (52:15) 如何开始使用 Biomni 一句话总结,AI不会替你做决定,但或许能把重复与繁琐清空,让你把时间花在‘思考问题’上。 本期涉及的AI助手: 1. 基因编辑AI助手:CRISPR-GPT 是首个专为基因编辑设计的 AI 科研助手,能自动生成 sgRNA 设计与实验方案,让 CRISPR 实验更高效、更智能。 Github:https://github.com/cong-lab/crispr-gpt-pub CRISPR-GPT beta program报名:https://www.surveymonkey.com/r/G9GCMJV 2. 全能型AI科研助手:Biomni 是一个由斯坦福团队开发的 AI 科研工作站,让研究者用自然语言即可完成从文献检索到实验设计与数据分析的全流程科研。 Biomni服务器:https://biomni.stanford.edu/ References: 1. Qu, Yuanhao, Kaixuan Huang, Ming Yin, Kanghong Zhan, Dyllan Liu, Di Yin, Henry C. Cousins et al. "CRISPR-GPT for agentic automation of gene-editing experiments." Nature Biomedical Engineering (2025): 1-14. 2. Huang, Kexin, Serena Zhang, Hanchen Wang, Yuanhao Qu, Yingzhou Lu, Yusuf Roohani, Ryan Li et al. "Biomni: A general-purpose biomedical ai agent." biorxiv (2025). 👥 本期嘉宾介绍 特邀嘉宾 屈元昊(Jerry Qu):斯坦福癌症生物学博士,CRISPR-GPT发明者之一,Biomni发明者之一,长期关注 AI × 生物的可规模化落地。 常驻嘉宾 🔬 可思叮:系统生物学博士,专注于高通量组学与疾病机制解析。目前在湾区一家生物技术公司从事科研工作,热衷于利用大数据解决生物医学难题 🧪 小橙:生物物理学博士,专注蛋白质与小分子相互作用。目前致力于新型靶向癌症疗法的开发,希望推动AI在临床医学中的应用。
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你是不是也有过这样的困扰:夜里翻来覆去睡不着,或者半夜频繁醒来?又或是在白天毫无征兆地突然犯困?今天的主角orexin,正是大脑里调节睡眠与清醒的关键开关。 今年的拉斯克奖,被称为"诺奖风向标",颁给了发现食欲素(orexin)的两位科学家。虽然我们没能押中诺奖,但不妨借着这股热度,聊聊这项同样"诺奖级"的发现。 斯坦福大学从上世纪70年代起,就饲养了一群一兴奋会突然瘫倒,会“猝睡”的狗狗,很像人类一种叫“发作性睡病”的罕见病。科学家埃马纽埃尔·米尼奥(Emmanuel Mignot)花了十多年追踪,最终锁定食欲素受体基因的突变是致病元凶。几乎同一时期,日本科学家柳泽正史(Masashi Yanagisawa)在寻找"孤儿受体"的配体时,发现了食欲素及其受体。两条完全独立的研究路线,在同一个分子上相遇,共同揭示了orexin在睡眠调节中的核心地位。 这个发现很快转化成了药物:基于"阻断orexin"的思路,新一代安眠药问世;而在2026年8月,FDA批准了首款从病因入手、激活orexin受体的发作性睡病新药。同一个分子,两种相反的用药策略。 发作性睡病虽然是罕见病,但GLP-1药物的经历告诉我们,一类药物的商业版图,往往会远远超出它最初的适应症。orexin药物的未来,或许不止于治疗疾病。那么,它会取代我们每天早上的那杯咖啡吗? (02:01) orexin:一个同时管睡眠、食欲和压力的分子 (04:01) 三十年的追寻 (07:48) 斯坦福那群一兴奋就"睡倒"的狗,藏着什么秘密? (11:43) 明明管睡觉,为什么叫"食欲素"? (15:37) 甲流疫苗引发发作性睡病?免疫系统的一次误伤 (23:26) 新一代安眠药 (27:14) 白天老犯困就是发作性睡病吗?怎么诊断 (31:15) 帕金森与睡眠障碍:从神经元丢失到REM睡眠异常 (39:01) FDA批准首款激活orexin受体的发作性睡病新药 本期嘉宾介绍 🔬 可思叮:纽约生物医药战略咨询师,UCSF生物医学博士,曾于某药企从事早期研发。广泛涉猎于癌症、代谢、神经退行性疾病、罕见病。希望和听友们一起成长,成为行走的生物医药encyclopedia。 🧠 小水博士:神经生物学博士,博士后研究员,研究神经退行性疾病中的细胞死亡机制,擅长干细胞、类器官建模与活细胞成像,同时深度应用 AI 进行疾病的机制研究。 🧑⚕️ Lulu:UCSF-UC Berkeley 联合培养代谢营养学博士。目前在湾区顶尖药企从事研发工作,专注于代谢与免疫交叉领域。她擅长从分子层面拆解慢性病机理,并能将前沿的科研发现转化为普通人也能听懂的医学知识。
这期我们聊聊"阳光维生素"。 提到维生素D,大家可能第一反应是课本上说的"缺乏会导致佝偻病",但其实维生素D对我们健康的影响远不止于此,它和糖尿病、心血管、免疫系统和神经退行性疾病都有潜在关联。 本期我们请到了营养流行病学家刘琰博士,详解维生素D的合成过程、食物来源和补充剂选择。为什么在日照充足的地方也有人缺乏?补剂和晒太阳效果一样吗?过量补充会不会中毒?不同人群该如何科学补充? (02:05) 工业革命时期的城市疾病与阳光之间的关系 (04:06) 维生素D的合成与人体健康 (06:24) 如何“正确”晒太阳? (09:35) 过量维生素D摄入是否安全? (16:01) 维生素D缺乏与肥胖、疾病关系 (22:26) 为什么阳光充足的印度与阿富汗,维生素D缺乏问题普遍? (28:51) 维生素D x 免疫:从分子层面理解维生素如何增强免疫力 (32:04) 维生素D在神经系统中的功能 👥 本期嘉宾介绍 特邀嘉宾 🥑 刘琰博士:营养流行病学博士,现任职于北京安贞医院临床与流行病研究中心。专注于营养流行病学与心血管慢病防治,致力于用人群大数据为临床精准营养提供科学依据。 常驻嘉宾 🔬 可思叮:纽约生物医药战略咨询师,UCSF生物医学博士,曾于某药企从事早期研发。广泛涉猎于癌症、代谢、神经退行性疾病、罕见病。希望和听友们一起成长,成为行走的生物医药encyclopedia。 🧠 小水博士:神经生物学博士,博士后研究员,研究神经退行性疾病中的细胞死亡机制,擅长干细胞、类器官建模与活细胞成像,同时深度应用 AI 进行疾病的机制研究。 🧑⚕️ Lulu:UCSF-UC Berkeley 联合培养代谢营养学博士。目前在湾区顶尖药企从事研发工作,专注于代谢与免疫交叉领域。她擅长从分子层面拆解慢性病机理,并能将前沿的科研发现转化为普通人也能听懂的医学知识。
9月21日是世界阿尔茨海默病日。这期我们回顾并致敬这个疾病背后的人们。一封 1986 年的信、一个被说成"被诅咒"的哥伦比亚山村,和一个只有七秒记忆的英国音乐家。 这期不聊机制,也不聊新药。我们把过去阿尔茨海默病系列里出现过的三个故事放在一起:三个被时间慢慢磨掉的人,和他们如何一点一点撑开了我们对这个病的理解。
如果治愈癌症是一场马拉松,那我们可能一下子往前冲了好几公里——但也可能只是原地热身。 近期,Moderna 和默沙东最近联合发布新闻稿:他们的 mRNA 个体化肿瘤疫苗联合 K 药,在黑色素瘤三期临床试验中达到了终点。消息一出,股价应声大涨——癌症治疗性疫苗做了四十年,这是第一次三期临床成功。 但同样是做这件事,曾经有一家更早入局的公司,如今却已经黯然退市,消失在了茫茫人海里。同样的技术,为什么两家公司会走向完全不同的命运? 这一期我们请回了老朋友、亲历过那家消失公司起起伏伏的病毒学家王宇歌(@子陵在听歌),还请来了免疫学外援小Y博士,一起聊聊几个还没解开的黑箱问题: 为什么癌症疫苗的第一个成功案例,一定是黑色素瘤?
咱——回顾一下过去,再展望一下将来[1]。 GLP1是现今当之无愧的药王,但减肥药不是这几年才有的生意。 1930 年代人们就开始大开脑洞,想办法“欺骗”我们的“能量工厂”线粒体,让它把能量直接“烧掉”。然而这初代减肥药并没有让我们成功瘦下来,反而是引起了很大的副作用,甚至有人因为身体过热而死亡。60-90年代,人们第一次想要通过神经调节而抑制食欲,却又引起了意料之外的副作用。 这一期我们先聊一聊减肥药简史:每一代药的分子机理是什么、为什么失败。人们是怎么想到GLP-1可以用来减肥的。再展望一下未来,看看GLP-1还有什么未解决的难点,又有什么新的思路、新的靶点值得我们关注? (00:04) 减肥药凭什么成了最大的生意 (01:08) 1933 年的 DNP:让线粒体空转,烧掉能量也烧死了人 (05:58) 挨冻能减肥吗 (11:06) 向大脑进军:Aminorex 与暴涨 20 倍的肺动脉高压 (14:27) 芬芬:抑制食欲和心脏瓣膜病变绑在同一个受体家族 (18:29) 奥利司他与成人纸尿裤 (22:43) 一只希拉毒蜥的口水,救活了被判"不可成药"的 GLP-1 (30:38) 一条脂肪酸链,换来一周一针 (37:24) 三个未解难题:肌肉流失、停药反弹、23% 的人吃了没用 (42:00) 下一站 INHBE / ALK7 [1] 赵本山, 宋丹丹, 等. 《昨天·今天·明天》. 北京: 中央电视台春节联欢晚会, 1999-02-15. 👥 本期嘉宾介绍 特邀嘉宾 🧑⚕️ Lulu:UCSF-UC Berkeley 联合培养代谢营养学博士。目前在湾区顶尖药企从事研发工作,专注于代谢与免疫交叉领域。她擅长从分子层面拆解慢性病机理,并能将前沿的科研发现转化为普通人也能听懂的医学知识。 常驻嘉宾 🧠 小水博士:神经生物学博士,博士后研究员,研究神经退行性疾病中的细胞死亡机制,擅长干细胞、类器官建模与活细胞成像,同时深度应用 AI 进行疾病的机制研究。 🧪 小橙:生物物理学博士,专注于化学生物学与肿瘤靶向治疗。目前致力于新型靶向癌症疗法的开发,并正在推动AI和精准医疗在临床医学中的应用。 🔬 可思叮:纽约生物医药战略咨询师,UCSF生物医学博士,曾于某药企从事早期研发。广泛涉猎于癌症、代谢、神经退行性疾病、罕见病。希望和听友们一起成长,成为行走的生物医药encyclopedia。